RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 ACTR2P61160 394 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 CFHP08603 1231 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 PTGIRP43119 386 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 GPC3P51654 580 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 SEZ6Q53EL9 994 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 CD101Q93033 1021 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 PTPRJQ12913 1337 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 MAPK13O15264 365 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 PDE6CP51160 858 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 CDR2Q01850 454 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 VPS33BQ9H267 617 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM260-216ENST00000557657 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 TIPINQ9BVW5 301 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 SMIM23A6NLE4 172 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 KRT71Q3SY84 523 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 KIFAP3Q92845 792 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 GPRASP2Q96D09 838 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 FBXL18Q96ME1 805 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.76■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 EBAG9O00559 213 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 GZMAP12544 262 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 ATP4AP20648 1035 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 DSG3P32926 999 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CORO7P57737 925 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CNTN2Q02246 1040 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 GPD1LQ8N335 351 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PICK1Q9NRD5 415 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 WDR81Q562E7 1941 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PHF2O75151 1096 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 RARAP10276 462 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 ODF2Q5BJF6 829 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 RAB17Q9H0T7 212 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.75■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CLDN3O15551 220 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CYP1A2P05177 515 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 EDN1P05305 212 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PTGISQ16647 500 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 O00370 1275 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PSAPP07602 524 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PASD1Q8IV76 773 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PMM2O15305 246 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CLSTN1O94985 981 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 SNX1Q13596 522 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 MDM1Q8TC05 714 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 CAND2O75155 1236 aa22.73■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 PPFIA2O75334 1257 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms