RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 LIN9Q5TKA1 542 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 B4GALT5O43286 388 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 KRT2P35908 639 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 TUSC3Q13454 348 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 CALCRLQ16602 461 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 CEP57Q86XR8 500 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 HINFPQ9BQA5 517 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 TTPALQ9BTX7 342 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXN3-211ENST00000555855 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 CDH7Q9ULB5 785 aa21.51■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PFKFB2O60825 505 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 XYLBO75191 536 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 SP9P0CG40 484 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 TXKP42681 527 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 RARRES1P49788 294 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 STARD6P59095 220 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 GPC5P78333 572 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 NR5A1Q13285 461 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 RTP2Q5QGT7 225 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PDXDC1Q6P996 788 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 POLIQ9UNA4 740 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 THP07101 528 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PSMD5Q16401 504 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 POTEGQ6S5H5 508 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PARM1Q6UWI2 310 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 MTSS1LQ765P7 747 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PJA1Q8NG27 643 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 ARID2Q68CP9 1835 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 FAM205CA6NFA0 338 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.48■■□□□ 1.03
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FOXN3-211ENST00000555855 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 HASPINQ8TF76 798 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 RUBCNQ92622 972 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 FGF14Q92915 247 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 BORCS6Q96GS4 357 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 BCO2Q9BYV7 579 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 FOXQ1Q9C009 403 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.48■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 A0A087WWV3 80 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 N4BP3O15049 544 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 ATP2B1P20020 1258 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 NTHL1P78549 312 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PRKCQQ04759 706 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 UVSSAQ2YD98 709 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.47■■□□□ 1.03
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FOXN3-211ENST00000555855 RMDN1Q96DB5 314 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.47■■□□□ 1.03
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FOXN3-211ENST00000555855 SNTG2Q9NY99 539 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 DMDP11532 3685 aa21.47■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 CCL16O15467 120 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 NEMFO60524 1076 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 KINO60870 393 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 DTNBO60941 627 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 HOXA9P31269 272 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PFKPQ01813 784 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 ANKRD1Q15327 319 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 FAM187BQ17R55 369 aa21.46■■□□□ 1.03
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