RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CDH7	Q9ULB5	785 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	7.6	□□□□□ -1.19	2e-6	■■■■■ 114.2
CS-233	ENST00000552688	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FAM205C	A6NFA0	338 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	EML1	O00423	815 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LAMTOR5	O43504	91 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MARCH6	O60337	910 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	XYLB	O75191	536 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DGAT1	O75907	488 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	POU2F2	P09086	479 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	XBP1	P17861	261 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SCNN1G	P51170	649 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GPC5	P78333	572 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP8	P85298	464 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	EMC2	Q15006	297 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	XKR9	Q5GH70	373 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LIN9	Q5TKA1	542 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NEK8	Q86SG6	692 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	OXER1	Q8TDS5	423 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LXN	Q9BS40	222 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RNF39	Q9H2S5	420 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MIOS	Q9NXC5	875 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	STK36	Q9NRP7	1315 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GUA9	196 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SLC37A4	O43826	429 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TBC1D4	O60343	1298 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LYPLA2	O95372	231 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MYB	P10242	640 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GJB2	P29033	226 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	LMNB2	Q03252	620 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	TUSC3	Q13454	348 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	INF2	Q27J81	1249 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PARM1	Q6UWI2	310 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HSCB	Q8IWL3	235 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SPOCK2	Q92563	424 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FGF13	Q92913	245 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FOXQ1	Q9C009	403 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	NCDN	Q9UBB6	729 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	HES2	Q9Y543	173 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CS-233	ENST00000552688	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	SLITRK3	O94933	977 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	C8A	P07357	584 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	GLUL	P15104	373 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	ATP2B1	P20020	1258 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	AKAP5	P24588	427 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	ARL2	P36404	184 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	NRL	P54845	237 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	NR5A1	Q13285	461 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	PPP2R5D	Q14738	602 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	NPY5R	Q15761	445 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CS-233	ENST00000552688	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		7.58	□□□□□ -1.2

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