RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552620.1

CHMP4A-210, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 716 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-210ENST00000552620 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.56□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 PIK3R2O00459 728 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CES2O00748 559 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF263O14978 683 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 MARCH6O60337 910 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 AOC2O75106 756 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 PPFIA4O75335 1185 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 MOCS3O95396 460 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 TTLL1O95922 423 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 USP11P51784 963 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 EPHB4P54760 987 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 GYS2P54840 703 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 GPSM2P81274 684 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CYP27A1Q02318 531 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 GABPAQ06546 454 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 PPFIA1Q13136 1202 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 DDR2Q16832 855 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CCDC181Q5TID7 509 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ILDR2Q71H61 639 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SRLQ86TD4 932 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 FBXO11Q86XK2 927 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 IFT20Q8IY31 132 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SVOPQ8N4V2 548 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CNBD1Q8NA66 436 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 WHAMMQ8TF30 809 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CUL5Q93034 780 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 MTMR8Q96EF0 704 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 WDR18Q9BV38 432 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 PANK4Q9NVE7 773 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 TMEM260Q9NX78 707 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SNTG2Q9NY99 539 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 GMIPQ9P107 970 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 JAG2Q9Y219 1238 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.55□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ATP8B3O60423 1300 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SNED1Q8TER0 1413 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 LRRC53A6NM62 1247 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 TRAF5O00463 557 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 TM4SF5O14894 197 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CETN3O15182 167 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF185O15231 689 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 EDIL3O43854 480 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 HSF2BPO75031 334 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ADAM11O75078 769 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 UFL1O94874 794 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 PGRP06401 933 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SELPP16109 830 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CYP3A7P24462 503 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 GUCY2CP25092 1073 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ID3Q02535 119 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 C2orf54Q08AI8 447 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF543Q08ER8 600 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 KCNMA1Q12791 1236 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 COASYQ13057 564 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 NFIXQ14938 502 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 NAB2Q15742 525 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.54□□□□□ -1.36
CHMP4A-210ENST00000552620 CRY2Q49AN0 593 aa6.54□□□□□ -1.36
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