RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	CCDC6	Q16204	474 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MTERF2	Q49AM1	385 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	UBXN11	Q5T124	520 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	BRAP	Q7Z569	592 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	NXPE3	Q969Y0	559 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		15.36	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	EFEMP2	O95967	443 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PSAP	P07602	524 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TDGF1	P13385	188 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GLUD2	P49448	558 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	REST	Q13127	1097 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FERMT3	Q86UX7	667 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ING5	Q8WYH8	240 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SLC5A5	Q92911	643 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FGF13	Q92913	245 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SHD	Q96IW2	340 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	NLRP4	Q96MN2	994 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	CEP89	Q96ST8	783 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	HES2	Q9Y543	173 aa		15.35	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	CCL16	O15467	120 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	C1QTNF9	P0C862	333 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ATP2B1	P20020	1258 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PKP1	Q13835	747 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TTC38	Q5R3I4	469 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	LILRA6	Q6PI73	481 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ZFP42	Q96MM3	310 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	RSAD1	Q9HA92	442 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	CHST12	Q9NRB3	414 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	CDH7	Q9ULB5	785 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		15.34	■□□□□ 0.05
CS-231	ENST00000552222	SPEG	Q15772	3267 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TBX3	O15119	743 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ADAM12	O43184	909 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	NEMF	O60524	1076 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZNF623	O75123	536 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	STBD1	O95210	358 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PML	P29590	882 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	MCM7	P33993	719 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	NBR1	Q14596	966 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	POTED	Q86YR6	584 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	URGCP	Q8TCY9	931 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	NETO1	Q8TDF5	533 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	HAS1	Q92839	578 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	CLDN23	Q96B33	292 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	FAM20A	Q96MK3	541 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	RIT2	Q99578	217 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	POLI	Q9UNA4	740 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	HR	O43593	1189 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	TBC1D4	O60343	1298 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZMYND10	O75800	440 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	PSMD10	O75832	226 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	DDIT3	P35638	169 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	SCNN1G	P51170	649 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	DSG1	Q02413	1049 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZNF174	Q15697	407 aa		15.32	■□□□□ 0.04
CS-231	ENST00000552222	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04

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