RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 FANCMQ8IYD8 2048 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 ZMYND10O75800 440 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 SLITRK3O94933 977 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 CD72P21854 359 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 AXLP30530 894 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 PJA1Q8NG27 643 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 HDAC7Q8WUI4 952 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 PHF20Q9BVI0 1012 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 USP20Q9Y2K6 914 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-227ENST00000551441 ADAM12O43184 909 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 GLRA2P23416 452 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SPIRE1Q08AE8 756 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 TFDP1Q14186 410 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PPP4R3AQ6IN85 833 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 GALNT17Q6IS24 598 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 ITFG1Q8TB96 612 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CCDC51Q96ER9 411 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SEMA4AQ9H3S1 761 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 FNIP2Q9P278 1114 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PPME1Q9Y570 386 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 ARL2P36404 184 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 GRIK3Q13003 919 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 UBXN2BQ14CS0 331 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 FAM171A1Q5VUB5 890 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PIGOQ8TEQ8 1089 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 RUBCNQ92622 972 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 KXD1Q9BQD3 176 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CLSTN3Q9BQT9 956 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 GPRC5CQ9NQ84 441 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 FBXW11Q9UKB1 542 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 TTLL13PA6NNM8 815 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 USO1O60763 962 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 KIF4AO95239 1232 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 C8AP07357 584 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 KCNA4P22459 653 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 STARD6P59095 220 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SCRN1Q12765 414 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 NR5A1Q13285 461 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PSMD5Q16401 504 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PPM1LQ5SGD2 360 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 LIN9Q5TKA1 542 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SLC27A1Q6PCB7 646 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 HACE1Q8IYU2 909 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 ING5Q8WYH8 240 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 FGF13Q92913 245 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SNTG2Q9NY99 539 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CDH7Q9ULB5 785 aa17.87■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 LRRIQ4A6NIV6 560 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 BAG4O95429 457 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 LIG1P18858 919 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 FOSBP53539 338 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SLC44A4Q53GD3 710 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SUMF1Q8NBK3 374 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 TTPALQ9BTX7 342 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 66.8
CS-227ENST00000551441 VWA8A3KMH1 1905 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 KANSL1LA0AUZ9 987 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 FAM170BA6NMN3 283 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 TBX3O15119 743 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 KINO60870 393 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PAPLNO95428 1278 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 TMEM132AQ24JP5 1023 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 TSSK4Q6SA08 328 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SLC7A14Q8TBB6 771 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PDRG1Q9NUG6 133 aa17.85■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CEP250Q9BV73 2442 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 NOTCH4Q99466 2003 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PATJQ8NI35 1801 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GUA9 196 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 WNT7AO00755 349 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PTGESO14684 152 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 LAMTOR5O43504 91 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 DGAT1O75907 488 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 TXKP42681 527 aa17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms