RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541416.5

SNHG1-216, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-216	ENST00000541416	TUSC3	Q13454	348 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	NPY5R	Q15761	445 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416		A0A1B0GUA9	196 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	NPTXR	O95502	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	STK3	Q13188	491 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	CAPS	Q13938	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	PSMD5	Q16401	504 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	WASF1	Q92558	559 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	HAS1	Q92839	578 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SNHG1-216	ENST00000541416	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416		F8W810	466 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SLITRK3	O94933	977 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	LYPLA2	O95372	231 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	C8A	P07357	584 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ARL2	P36404	184 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	GPC5	P78333	572 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	AMHR2	Q16671	573 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	POTED	Q86YR6	584 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	FGF14	Q92915	247 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	NELL2	Q99435	816 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	N4BP3	O15049	544 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	TH	P07101	528 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	POU2F2	P09086	479 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	FGF13	Q92913	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	ZBTB39	O15060	712 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CCL16	O15467	120 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	GLRA2	P23416	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	RARRES1	P49788	294 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	CALCRL	Q16602	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SNHG1-216	ENST00000541416	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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