RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD54Q6NXT1 300 aa18.28■□□□□ 0.52
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PKP3-209ENST00000533069 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa18.28■□□□□ 0.52
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PKP3-209ENST00000533069 EPSTI1Q96J88 318 aa18.26■□□□□ 0.51
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PKP3-209ENST00000533069 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
PKP3-209ENST00000533069 STK38Q15208 465 aa18.23■□□□□ 0.51
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PKP3-209ENST00000533069 XKR4Q5GH76 650 aa18.23■□□□□ 0.51
PKP3-209ENST00000533069 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.23■□□□□ 0.51
PKP3-209ENST00000533069 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.23■□□□□ 0.51
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