RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 MFSD1Q9H3U5 465 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 CLUHO75153 1309 aa26.53■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.843e-6■■■■■ 110.9
ACER3-211ENST00000531461 PROB1E7EW31 1015 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 ACKR2O00590 384 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 TGM5O43548 720 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 ST18O60284 1047 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 TADA2AO75478 443 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 RFPL2O75678 378 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 TRAPPC10P48553 1259 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 PPP2R5AQ15172 486 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 BSNDQ8WZ55 320 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 NXPE3Q969Y0 559 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 B3GALT6Q96L58 329 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.52■■□□□ 1.84
ACER3-211ENST00000531461 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 H0Y858 1186 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 SEC24BO95487 1268 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 ZNF174Q15697 407 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.51■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PTGESO14684 152 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PRKCBP05771 671 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 THP07101 528 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 NAB2Q15742 525 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PALB2Q86YC2 1186 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PAAF1Q9BRP4 392 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PRKD2Q9BZL6 878 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 SNTG2Q9NY99 539 aa26.5■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 EFNA5P52803 228 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 RTP2Q5QGT7 225 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 TTC38Q5R3I4 469 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 DEPTORQ8TB45 409 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PIK3R5Q8WYR1 880 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 TRIP11Q15643 1979 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 VWA8A3KMH1 1905 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 CFAP54Q96N23 3096 aa26.49■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 ZMYND10O75800 440 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 RECQL4O94761 1208 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 SPATA31D3P0C874 917 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 NPR3P17342 541 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 AOC1P19801 751 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 RABGGTAQ92696 567 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 KIFAP3Q92845 792 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 TTPALQ9BTX7 342 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 WNT16Q9UBV4 365 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 STK24Q9Y6E0 443 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 DOCK6Q96HP0 2047 aa26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 VPS13AQ96RL7 3174 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 GFRA3O60609 400 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 KIF4AO95239 1232 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 NBL1P41271 181 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PDIA5Q14554 519 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PDXDC1Q6P996 788 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 MYADMQ96S97 322 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 RTP3Q9BQQ7 232 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 PIDD1Q9HB75 910 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.47■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 EDN1P05305 212 aa26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 RPL17P18621 184 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 IFT74Q96LB3 600 aa26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 FBXL21Q9UKT6 434 aa26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ACER3-211ENST00000531461 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.823e-6■■■□□ 15.4
ACER3-211ENST00000531461 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 ECM1Q16610 540 aa26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 GLYCTKQ8IVS8 523 aa26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.45■■□□□ 1.82
ACER3-211ENST00000531461 FLCNQ8NFG4 579 aa26.45■■□□□ 1.82
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