RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 CHD8Q9HCK8 2581 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 DCDC2BA2VCK2 349 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 M0R2N6 131 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 XYLBO75191 536 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 TADA2AO75478 443 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 C8AP07357 584 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 ADRB1P08588 477 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 POU2F2P09086 479 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 CD72P21854 359 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 POU5F1BQ06416 359 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 ST3GAL2Q16842 350 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 RTP2Q5QGT7 225 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 C4orf19Q8IY42 314 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 ITFG1Q8TB96 612 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 APOL6Q9BWW8 343 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 VAV3Q9UKW4 847 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 ARID2Q68CP9 1835 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 CPA1P15085 419 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM20AQ96MK3 541 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 KXD1Q9BQD3 176 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 TTPALQ9BTX7 342 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 GMEB2Q9UKD1 530 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 CCL16O15467 120 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC37A4O43826 429 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 AKAP5P24588 427 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 TFDP1Q14186 410 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 PSMD5Q16401 504 aa18.16■□□□□ 0.5
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PACSIN3-206ENST00000530405 UVSSAQ2YD98 709 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 TSSK4Q6SA08 328 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 BLIDQ8IZY5 108 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 DAGLBQ8NCG7 672 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 RABGGTAQ92696 567 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 MTRQ99707 1265 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNMB3Q9NPA1 279 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 PARD6AQ9NPB6 346 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 POLIQ9UNA4 740 aa18.16■□□□□ 0.5
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PACSIN3-206ENST00000530405 CHD6Q8TD26 2715 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 NOTCH4Q99466 2003 aa18.16■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 ECI2O75521 394 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 ADCY1Q08828 1119 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 TUSC3Q13454 348 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 FZD5Q13467 585 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 XKR9Q5GH70 373 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 PDXDC1Q6P996 788 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 LXNQ9BS40 222 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 USP24Q9UPU5 2620 aa18.15■□□□□ 0.5
PACSIN3-206ENST00000530405 NRLP54845 237 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 EPHA7Q15375 998 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 GALNT17Q6IS24 598 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 RTL10Q7L3V2 364 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNB2Q92953 911 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 KLK14Q9P0G3 267 aa18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 A0A1B0GUA9 196 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 TDGF1P13385 188 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 EVCP57679 992 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 MTAPQ13126 283 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 CAPSQ13938 189 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 RAB33AQ14088 237 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 NPY5RQ15761 445 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 INF2Q27J81 1249 aa18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3-206ENST00000530405 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.13■□□□□ 0.49
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