RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-205ENST00000527952 RTP2Q5QGT7 225 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-205ENST00000527952 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-205ENST00000527952 FZD8Q9H461 694 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-205ENST00000527952 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-205ENST00000527952 IGSF9Q9P2J2 1179 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-205ENST00000527952 STK25O00506 426 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 AOC1P19801 751 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 LILRA6Q6PI73 481 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP57Q86XR8 500 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 STAMQ92783 540 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CA14Q9ULX7 337 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PTGESO14684 152 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 KIF4AO95239 1232 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SEC24BO95487 1268 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TUSC3Q13454 348 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PADI6Q6TGC4 694 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NACC1Q96RE7 527 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 FNIP2Q9P278 1114 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 DMDP11532 3685 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 KRBA1A5PL33 1030 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PRKCBP05771 671 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 HDAC7Q8WUI4 952 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PRKD2Q9BZL6 878 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 GDAQ9Y2T3 454 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIP11Q15643 1979 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CFAP54Q96N23 3096 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PROB1E7EW31 1015 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 N4BP3O15049 544 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 RECQL4O94761 1208 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NBL1P41271 181 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NTHL1P78549 312 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM187BQ17R55 369 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 VWA8A3KMH1 1905 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PRR23AA6NEV1 266 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ZMYND10O75800 440 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 OR52Z1P0C646 297 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ECM1Q16610 540 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 DEPTORQ8TB45 409 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 C8orf76Q96K31 380 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TTPALQ9BTX7 342 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.845e-6■■■■■ 107.1
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PTPRJ-205ENST00000527952 ADAM12O43184 909 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 THP07101 528 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP11B2P19099 503 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 RFX1P22670 979 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NBR1Q14596 966 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 MAPK6Q16659 721 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC105Q8IYK2 499 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 DTWD2Q8NBA8 298 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ERMNQ8TAM6 284 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 C2orf40Q9H1Z8 148 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 LAMP2P13473 410 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 RPA1P27694 616 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 ANGPT1Q15389 498 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 NAB2Q15742 525 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 PSMD5Q16401 504 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 GLRA4Q5JXX5 417 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR152Q8TDT2 470 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 RTP3Q9BQQ7 232 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 WNT16Q9UBV4 365 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 ACKR2O00590 384 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 CREMQ03060 361 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 TTC38Q5R3I4 469 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 ADPGKQ9BRR6 497 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-205ENST00000527952 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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