RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.14■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 PROZP22891 400 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 FCGRTP55899 365 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 VPS36Q86VN1 386 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ZNF516Q92618 1163 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 CTAGE9A4FU28 777 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 TNNI1P19237 187 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 NOGQ13253 232 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ATF7IP2Q5U623 682 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ZBTB33Q86T24 672 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 MAP7D2Q96T17 732 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 PTPRHQ9HD43 1115 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 A0A087WZ62 844 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 OGTO15294 1046 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 TOMM70O94826 608 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 CPT1AP50416 773 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 FAM187BQ17R55 369 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ZACNQ401N2 412 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 KAT2BQ92831 832 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 NT5C1BQ96P26 610 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 VTNP04004 478 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 PSMC4P43686 418 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 CGRRF1Q99675 332 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 B4GALT5O43286 388 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 KIF22Q14807 665 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 SEZ6Q53EL9 994 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 SETD4Q9NVD3 440 aa25.11■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 DYNC1I1O14576 645 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 IQCF3P0C7M6 154 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 MFAP3P55082 362 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 HELQQ8TDG4 1101 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 NAGPAQ9UK23 515 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 PTPRJQ12913 1337 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 NRCAMQ92823 1304 aa25.1■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 AKR1A1P14550 325 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 TNFSF9P41273 254 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 KAT5Q92993 513 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 SYT11Q9BT88 431 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 NENFQ9UMX5 172 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ZEB2O60315 1214 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 NAB2Q15742 525 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 FAM84AQ96KN4 292 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R16BQ96T49 567 aa25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 MFSD10Q14728 455 aa25.08■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 AMHR2Q16671 573 aa25.08■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.08■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 SHC3Q92529 594 aa25.08■■□□□ 1.61
ACER3-204ENST00000525861 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.612e-29■■■■■ 310.5
ACER3-204ENST00000525861 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.63e-17■■■■■ 71.6
ACER3-204ENST00000525861 EEF1DP3Q658K8 133 aa25.08■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 ZNF410Q86VK4 478 aa25.08■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 TRIM58Q8NG06 486 aa25.08■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 NLRP7Q8WX94 980 aa25.08■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 ATP8B3O60423 1300 aa25.08■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 HAS3O00219 553 aa25.07■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 HLA-DRAP01903 254 aa25.07■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 AP3M2P53677 418 aa25.07■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 GCNT1Q02742 428 aa25.07■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 BIRC3Q13489 604 aa25.07■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 TUBB2AQ13885 445 aa25.07■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.07■■□□□ 1.6
ACER3-204ENST00000525861 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms