RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 TTC4O95801 387 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CACNB3P54284 484 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MPP2Q14168 576 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 RASA3Q14644 834 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 DOK7Q18PE1 504 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ASRGL1Q7L266 308 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 C7orf43Q8WVR3 580 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 KREMEN1Q96MU8 473 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 IDI2Q9BXS1 227 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM206Q9H813 350 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 RXFP1Q9HBX9 757 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 PRR12Q9ULL5 1215 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ARHGEF35A5YM69 484 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 K7ENM7 598 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 DLATP10515 647 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MAPTP10636 758 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CCND1P24385 295 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ABCB5Q2M3G0 1257 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 SGO2Q562F6 1265 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 SLC47A2Q86VL8 602 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 FITM2Q8N6M3 262 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 C1orf54Q8WWF1 131 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF653Q96CK0 615 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 KLHL29Q96CT2 875 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CBWD1Q9BRT8 395 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 LXNQ9BS40 222 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 WDR11Q9BZH6 1224 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 KCNQ5Q9NR82 932 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MAPK13O15264 365 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CYP26A1O43174 497 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 GDF11O95390 407 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 KRT16P08779 473 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ALCAMQ13740 583 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 PTK6Q13882 451 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CEP55Q53EZ4 464 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ANKRD42Q8N9B4 389 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 SHC3Q92529 594 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 SNF8Q96H20 258 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 IFT74Q96LB3 600 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM117Q9H0C3 514 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ACP6Q9NPH0 428 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 LGALS13Q9UHV8 139 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CFBP00751 764 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 PDE6BP35913 854 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MXI1P50539 228 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 RNF43Q68DV7 783 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CGB2Q6NT52 195 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 XXYLT1Q8NBI6 393 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ACCSQ96QU6 501 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF577Q9BSK1 485 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 PLVAPQ9BX97 442 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 KCNK9Q9NPC2 374 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 BATF3Q9NR55 127 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CHST7Q9NS84 486 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 HSPBP1Q9NZL4 362 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ASIC3Q9UHC3 531 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 PNMA3Q9UL41 463 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 FOXO6A8MYZ6 492 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 GH1P01241 217 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 POLR2MP0CAP2 368 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ARP10275 920 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 BRAFP15056 766 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MAN1A1P33908 653 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ITGA8P53708 1063 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 JAG1P78504 1218 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CDR2Q01850 454 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CAV1Q03135 178 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 NAA25Q14CX7 972 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 KYNUQ16719 465 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 FAM182BQ5T319 152 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 PADI6Q6TGC4 694 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CYP4X1Q8N118 509 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 KIF2BQ8N4N8 673 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 FAXDC2Q96IV6 333 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MAGEB18Q96M61 343 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MRIQ9BWK5 157 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MLXIPLQ9NP71 852 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1W2PRG0 241 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 SORBS3O60504 671 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 VIL1P09327 827 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CCNB1P14635 433 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CYP11B1P15538 503 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MSH2P43246 934 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MFAP3P55082 362 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 MGAT5Q09328 741 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC15Q0P6D6 951 aa12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms