RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515707.1

ABCC3-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ABCC3, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-217ENST00000515707 IRAK3Q9Y616 596 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 H0YCG3 227 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 PTGESO14684 152 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 PROZP22891 400 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CA8P35219 290 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF131P52739 623 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 NCKAP1LP55160 1127 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 GIT2Q14161 759 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 PTPN14Q15678 1187 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 KCNN1Q92952 543 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 PARVGQ9HBI0 331 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 GDAQ9Y2T3 454 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ABLIM1O14639 778 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MBTPS2O43462 519 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 FAM13AO94988 1023 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 YEATS4O95619 227 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 BRD1O95696 1058 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CXCL14O95715 111 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 F13A1P00488 732 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SCP2P22307 547 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 GRM5P41594 1212 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 TUSC3Q13454 348 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 F8W810 466 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 EFEMP2O95967 443 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SOD2P04179 222 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 MCF2P10911 925 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 DDIT3P35638 169 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ZPBP2Q6X784 338 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCC3-217ENST00000515707 K7ENM7 598 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 SPTLC2O15270 562 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 PPP6R2O75170 966 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 TOM1L1O75674 476 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 URODP06132 367 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 THP07101 528 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 PKP1Q13835 747 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 NAB2Q15742 525 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 MYCT1Q8N699 235 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 CEP120Q8N960 986 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 STAT6P42226 847 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 ZBTB33Q86T24 672 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 CASP10Q92851 521 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 TCHPQ9BT92 498 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 PLXNA3P51805 1871 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 GLUD2P49448 558 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 ZP2Q05996 745 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 FUT10Q6P4F1 479 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 BICD1Q96G01 975 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 A0A087X0B3 334 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 TRAK2O60296 914 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 ABCD1P33897 745 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 OSTNP61366 133 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 RABGGTAQ92696 567 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 SNX27Q96L92 541 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCC3-217ENST00000515707 FIZ1Q96SL8 496 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms