RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SFXN1Q9H9B4 322 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNTG2Q9NY99 539 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RECQL4O94761 1208 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CREMQ03060 361 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP41Q3LFD5 358 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EEF1DP3Q658K8 133 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FUT10Q6P4F1 479 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNK18Q7Z418 384 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DAW1Q8N136 415 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP20Q9Y2K6 914 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTGESO14684 152 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEX28O15482 410 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMTNP53814 917 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZXDAP98168 799 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAPK7Q13164 816 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR149Q86SP6 731 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PNMA5Q96PV4 448 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POMKQ9H5K3 350 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FNIP2Q9P278 1114 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USTQ9Y2C2 406 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 F8W810 466 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GLUD1P00367 558 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EDN1P05305 212 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLS3P13797 630 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBA7P41226 1012 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CALML4Q96GE6 196 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDAQ9Y2T3 454 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C5orf42Q9H799 3197 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H0YCG3 227 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLA2G4BP0C869 781 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRM5P41594 1212 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YARSP54577 528 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC12A3P55017 1021 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STRN3Q13033 797 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPN21Q16825 1174 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLIN2Q99541 437 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCHPQ9BT92 498 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BACH2Q9BYV9 841 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SFI1A8K8P3 1242 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC16A4O15374 487 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WEE2P0C1S8 567 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCF2P10911 925 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCP2P22307 547 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAB2Q15742 525 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF568Q3ZCX4 644 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KANK3Q6NY19 840 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDXDC1Q6P996 788 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB33Q86T24 672 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RABGGTAQ92696 567 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UROC1Q96N76 676 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTPALQ9BTX7 342 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDH22Q9UJ99 828 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM221A6NGB7 291 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C2CD4DB7Z1M9 353 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 M0R296 226 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF4AO95239 1232 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BRD1O95696 1058 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms