RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 SIP14410 1827 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 PDHXO00330 501 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM253P0C7T8 217 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRNB2P17787 502 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC26A2P50443 739 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 WNT7BP56706 349 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 STRN3Q13033 797 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 DRP2Q13474 957 aa11.66□□□□□ -0.54
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SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR93Q6P2C0 686 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ZPBP2Q6X784 338 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 USP37Q86T82 979 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 COPS5Q92905 334 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 KATNBL1Q9H079 304 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 AZI2Q9H6S1 392 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCB6Q9NP58 842 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB20Q9NX57 234 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 CES2O00748 559 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 STRNO43815 780 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 MFAP3P55082 362 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNA1P78396 465 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 CAP1Q01518 475 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP1Q07960 439 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TTLL4Q14679 1199 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ZACNQ401N2 412 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ARMCX2Q7L311 632 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 SCFD2Q8WU76 684 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TCP11Q8WWU5 503 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TATDN2Q93075 761 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 BICD1Q96G01 975 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA33Q96N06 139 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 NT5C1BQ96P26 610 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ISCUQ9H1K1 167 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP2-209ENST00000504450 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 ABLIM1O14639 778 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 HBP1O60381 514 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 MSCO60682 206 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 SGPL1O95470 568 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 FTCDO95954 541 aa11.64□□□□□ -0.55
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SH3BP2-209ENST00000504450 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 EFNA5P52803 228 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 VSNL1P62760 191 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 GCNT1Q02742 428 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMC2Q13753 1193 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM50Q86XT4 487 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 PALB2Q86YC2 1186 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 GLG1Q92896 1179 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 FUT8Q9BYC5 575 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 VTA1Q9NP79 307 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.64□□□□□ -0.55
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