RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 SHC4Q6S5L8 630 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 CEP120Q8N960 986 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 VN1R3Q9BXE9 311 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 ZBP1Q9H171 429 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 MARCH5Q9NX47 278 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 CFAP45Q9UL16 551 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-205ENST00000496887 CITO14578 2027 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 K7ENM7 598 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 ABLIM1O14639 778 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 TBX10O75333 385 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 NR1I2O75469 434 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CXCL14O95715 111 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 MCF2P10911 925 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CA8P35219 290 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 OSTNP61366 133 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 DUSP6Q16828 381 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 DDX12PQ92771 950 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 C5orf42Q9H799 3197 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 C2orf71A6NGG8 1288 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 F8W810 466 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 TOM1L1O75674 476 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 THP07101 528 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 HARSP12081 509 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 SCP2P22307 547 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 NMT1P30419 496 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 GRM5P41594 1212 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 ME1P48163 572 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 NDUFV1P49821 464 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 ZPBP2Q6X784 338 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 RABGGTAQ92696 567 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNN1Q92952 543 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 BICD1Q96G01 975 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 FIZ1Q96SL8 496 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 RCOR1Q9UKL0 485 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 TBX20Q9UMR3 447 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 TCHHQ07283 1943 aa18.5■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 BDP1A6H8Y1 2624 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 GLP2RO95838 553 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CTSAP10619 480 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 NAB2Q15742 525 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CLUL1Q15846 466 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 SFR1Q86XK3 245 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CLEC1BQ9P126 229 aa18.49■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CLDN3O15551 220 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 GTF2BQ00403 316 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 TUSC3Q13454 348 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 E2F4Q16254 413 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 GLRA4Q5JXX5 417 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 TAS1R1Q7RTX1 841 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 STAMQ92783 540 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 DHX58Q96C10 678 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 HAPLN2Q9GZV7 340 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 STK39Q9UEW8 545 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 MUC3AQ02505 3323 aa18.48■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 FSD2A1L4K1 749 aa18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 EFEMP2O95967 443 aa18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 GAP43P17677 238 aa18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 LIG4P49917 911 aa18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 MCL1Q07820 350 aa18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 KCNC3Q14003 757 aa18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPN14Q15678 1187 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms