RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487558.1

CUL3-211, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 1,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-211ENST00000487558 MORC1Q86VD1 984 aa7.19□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 GJA10Q969M2 543 aa7.19□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.19□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 MYD88Q99836 296 aa7.19□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.19□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 A0A088AWK7 358 aa7.18□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 MGEA5O60502 916 aa7.18□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 PRR31Q5SQ13 230 aa7.18□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.18□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 Q6ZVL8 140 aa7.17□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 ZNF480Q8WV37 535 aa7.17□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 PTPN18Q99952 460 aa7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.17□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 BCO1Q9HAY6 547 aa7.17□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.17□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 ZNF28P17035 718 aa7.16□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 CLEC14AQ86T13 490 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 SRLQ86TD4 932 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.16□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 OR7D4Q8NG98 312 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 NUDT11Q96G61 164 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 KATNBL1Q9H079 304 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 TLR9Q9NR96 1032 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.16□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 H3BUI4 141 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 SMARCA1P28370 1054 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 CRHR1P34998 444 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 KIR2DL3P43628 341 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 SLC6A9P48067 706 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 RAB1AP62820 205 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 PCOLCEQ15113 449 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 LONRF1Q17RB8 773 aa7.15□□□□□ -1.26
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CUL3-211ENST00000487558 UBXN11Q5T124 520 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 Q6ZUG5 572 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 KRT78Q8N1N4 520 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 IL17RAQ96F46 866 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.15□□□□□ -1.26
CUL3-211ENST00000487558 NOBOXO60393 691 aa7.14□□□□□ -1.27
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