RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476564.5

MTERF4-215, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

TSL 2

Gene MTERF4, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-215	ENST00000476564	TPM4	P67936	248 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	BFSP1	Q12934	665 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	PSMD6	Q15008	389 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	MAN2A1	Q16706	1144 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	XKR4	Q5GH76	650 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	CEP120	Q8N960	986 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	APBB2	Q92870	758 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	CYP2C18	P33260	490 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	TNFSF9	P41273	254 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	WNT7B	P56706	349 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	FANCC	Q00597	558 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	SNX27	Q96L92	541 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MTERF4-215	ENST00000476564	PTPRJ	Q12913	1337 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564		A0A0U1RQF3	1178 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ZNF233	A6NK53	670 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564		C9IYK1	514 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	IL18RAP	O95256	599 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NPTXR	O95502	500 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PFKM	P08237	780 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	STAG3L1	P0CL83	205 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	GTF2H1	P32780	548 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PBX1	P40424	430 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	FAM189B	P81408	668 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	IPP	Q9Y573	584 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	GBF1	Q92538	1859 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RECQL4	O94761	1208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CXCL8	P10145	99 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ACOT2	P49753	483 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ZBTB33	Q86T24	672 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CXorf38	Q8TB03	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SEPT8	Q92599	483 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	SCLY	Q96I15	445 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	CGRRF1	Q99675	332 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	ASB7	Q9H672	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	DERA	Q9Y315	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	C2CD2	Q9Y426	696 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564		A0A1W2PQC6	194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MTERF4-215	ENST00000476564	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms