RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 KIF4AO95239 1232 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 ADH1AP07327 375 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 AXLP30530 894 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 POU5F1BQ06416 359 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 ECM1Q16610 540 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 PARM1Q6UWI2 310 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 TMEM130Q8N3G9 435 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 ITFG1Q8TB96 612 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 CCDC51Q96ER9 411 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 NFKBIZQ9BYH8 718 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 FOXQ1Q9C009 403 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 FZD8Q9H461 694 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D17Q9HA65 648 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 ANKEF1Q9NU02 776 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 SNTG2Q9NY99 539 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 FNIP2Q9P278 1114 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 ADAM28Q9UKQ2 775 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 NUMBLQ9Y6R0 609 aa12.05□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 SPTBN2O15020 2390 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 VWA8A3KMH1 1905 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 CARNS1A5YM72 827 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 USO1O60763 962 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 ZMYND10O75800 440 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 DGAT1O75907 488 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 ERLIN2O94905 339 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 SRFP11831 508 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 TXKP42681 527 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 GPC5P78333 572 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 CATSPER3Q86XQ3 398 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 KIFC3Q9BVG8 833 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 COLEC11Q9BWP8 271 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 CCDC113Q9H0I3 377 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 UBN1Q9NPG3 1134 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 FBXW11Q9UKB1 542 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 FBXL21Q9UKT6 434 aa12.04□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 KRT2P35908 639 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 USP41Q3LFD5 358 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 SPECC1Q5M775 1068 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 SLC27A1Q6PCB7 646 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 DCLK2Q8N568 766 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 C3orf58Q8NDZ4 430 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 HDAC7Q8WUI4 952 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 RTP3Q9BQQ7 232 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 PARP2Q9UGN5 583 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 PCDHA12Q9UN75 941 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-206ENST00000474188 CCL16O15467 120 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 RECQL4O94761 1208 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 GRIK3Q13003 919 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CALCRLQ16602 461 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 NT5DC1Q5TFE4 455 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 FAM171A1Q5VUB5 890 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 CYP26C1Q6V0L0 522 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 EXOC8Q8IYI6 725 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 GPR65Q8IYL9 337 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SLFN12Q8IYM2 578 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PIK3R5Q8WYR1 880 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 GTF3C6Q969F1 213 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 RMDN1Q96DB5 314 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ARHGEF3Q9NR81 526 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 STK39Q9UEW8 545 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 LRRIQ4A6NIV6 560 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 I3L4J1 428 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TADA2AO75478 443 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 C1RP00736 705 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SP9P0CG40 484 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 GUCY1B3Q02153 619 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TUSC3Q13454 348 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-206ENST00000474188 TFDP1Q14186 410 aa12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms