RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465627.5

UBA3-208, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, human

TSL 2

Gene UBA3, Length 1,388 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBA3-208	ENST00000465627	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	FZD8	Q9H461	694 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF576	Q9H609	170 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	SETD4	Q9NVD3	440 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	N4BP3	O15049	544 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	MYL3	P08590	195 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GART	P22102	1010 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	DNM2	P50570	870 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	EFNA5	P52803	228 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ENPEP	Q07075	957 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	CEP135	Q66GS9	1140 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ZPBP2	Q6X784	338 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	RNF149	Q8NC42	400 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	RETREG2	Q8NC44	543 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	SLC35C1	Q96A29	364 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	NDST4	Q9H3R1	872 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		9.63	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627		A0A0B4J269	797 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ACKR2	O00590	384 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GPR32	O75388	356 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ADRB2	P07550	413 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ANK1	P16157	1881 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	FECH	P22830	423 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	DNAJB2	P25686	324 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GPC3	P51654	580 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	IGBP1	P78318	339 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	KCNMA1	Q12791	1236 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ARID5B	Q14865	1188 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	TMC6	Q7Z403	805 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	RPAIN	Q86UA6	219 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	SPC24	Q8NBT2	197 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	TMX1	Q9H3N1	280 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	USP20	Q9Y2K6	914 aa		9.62	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF292	O60281	2723 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	FAM186A	A6NE01	2351 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627		K7ERI5	159 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	PMM2	O15305	246 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	TREH	O43280	583 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GFRA3	O60609	400 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	VTN	P04004	478 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	GYPC	P04921	128 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	TPM3	P06753	285 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ASGR1	P07306	291 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	COL6A1	P12109	1028 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	IGFBP4	P22692	258 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	CYP2J2	P51589	502 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	CLDN10	P78369	228 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	UBXN1	Q04323	297 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	TFDP1	Q14186	410 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	KCNA10	Q16322	511 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		9.61	□□□□□ -0.87
UBA3-208	ENST00000465627	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		9.61	□□□□□ -0.87

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