RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 CASP10Q92851 521 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXB3-202ENST00000460160 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXB3-202ENST00000460160 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXB3-202ENST00000460160 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXB3-202ENST00000460160 S1PR5Q9H228 398 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXB3-202ENST00000460160 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXB3-202ENST00000460160 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
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HOXB3-202ENST00000460160 HSCBQ8IWL3 235 aa26.01■■□□□ 1.75
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HOXB3-202ENST00000460160 USP28Q96RU2 1077 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 REEP2Q9BRK0 252 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 CDT1Q9H211 546 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 EPHX3Q9H6B9 360 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 SMTNP53814 917 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 TUSC3Q13454 348 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 MCM6Q14566 821 aa26■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 NAB2Q15742 525 aa26■■□□□ 1.75
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HOXB3-202ENST00000460160 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26■■□□□ 1.75
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HOXB3-202ENST00000460160 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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HOXB3-202ENST00000460160 CEP120Q8N960 986 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 SLC22A17Q8WUG5 538 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 CLIC6Q96NY7 704 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 PAAF1Q9BRP4 392 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 APOL5Q9BWW9 433 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 THP07101 528 aa25.98■■□□□ 1.75
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HOXB3-202ENST00000460160 EPCAMP16422 314 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 C2CD2LO14523 706 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 URODP06132 367 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 GRM5P41594 1212 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 GLUD2P49448 558 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 STRN3Q13033 797 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 SLC39A14Q15043 492 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 FUT10Q6P4F1 479 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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HOXB3-202ENST00000460160 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB33Q86T24 672 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 CHST7Q9NS84 486 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 PLXNA3P51805 1871 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 MCF2P10911 925 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 DSG1Q02413 1049 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 KCNN1Q92952 543 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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HOXB3-202ENST00000460160 CDH22Q9UJ99 828 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-202ENST00000460160 DDIT3P35638 169 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 CLCN4P51793 760 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 OSTNP61366 133 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 B3GALT6Q96L58 329 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TCHPQ9BT92 498 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 PARVGQ9HBI0 331 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 DZANK1Q9NVP4 752 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 VWA8A3KMH1 1905 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 H0YCG3 227 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 TOM1L1O75674 476 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 FAM13AO94988 1023 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 KIF4AO95239 1232 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 KLRC2P26717 231 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 ZPBP2Q6X784 338 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-202ENST00000460160 MYCT1Q8N699 235 aa25.94■■□□□ 1.74
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