RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 EPN2O95208 641 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 GALTP07902 379 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 KCNA2P16389 499 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 ATP2B1P20020 1258 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 PDCP20941 246 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 KLRC1P26715 233 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 SATB1Q01826 763 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 PROSER1Q86XN7 944 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 TICAM2Q86XR7 235 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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HDAC6-210ENST00000441703 NEK11Q8NG66 645 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 UBXN4Q92575 508 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 SMARCE1Q969G3 411 aa7.15□□□□□ -1.26
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HDAC6-210ENST00000441703 CEP89Q96ST8 783 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 KXD1Q9BQD3 176 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 EDEM2Q9BV94 578 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.15□□□□□ -1.26
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HDAC6-210ENST00000441703 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC6-210ENST00000441703 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 A0A0D9SFI3 127 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 USP27XA6NNY8 438 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 C4orf47A7E2U8 309 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 KLRF2D3W0D1 207 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 NRDCO43847 1150 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 TADA3O75528 432 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SPATA31D3P0C874 917 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 CEACAM1P13688 526 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDAC6-210ENST00000441703 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDAC6-210ENST00000441703 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 EVI5LQ96CN4 794 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDAC6-210ENST00000441703 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 DEF6Q9H4E7 631 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDAC6-210ENST00000441703 VPS45Q9NRW7 570 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 DACT1Q9NYF0 836 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 DONSONQ9NYP3 566 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 CEP83Q9Y592 693 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDAC6-210ENST00000441703 TRIM66O15016 1216 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 TEX28O15482 410 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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HDAC6-210ENST00000441703 CCDC172P0C7W6 258 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 GJB2P29033 226 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 MPLP40238 635 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 SLC11A1P49279 550 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 STAT5BP51692 787 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 CORO7P57737 925 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 TROAPQ12815 778 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 FZD5Q13467 585 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-210ENST00000441703 BRD3Q15059 726 aa7.13□□□□□ -1.27
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