RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

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Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CYCSP43-201ENST00000438233 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP43-201ENST00000438233 C11orf49Q9H6J7 331 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP43-201ENST00000438233 ERVK13-1Q9NX77 482 aa4.59□□□□□ -1.67
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MYH1P12882 1939 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 KMT2EQ8IZD2 1858 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ALG1L2C9J202 215 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ARNTLO00327 626 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 TIMM44O43615 452 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 KPNA6O60684 536 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 TGFB1P01137 390 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 LDHCP07864 332 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 LCP1P13796 627 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 HOXD10P28358 340 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PMLP29590 882 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 GNALP38405 381 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 EPHB4P54760 987 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PAK1Q13153 545 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 LAPTM5Q13571 262 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 DHCR24Q15392 516 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 SHHQ15465 462 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MSMPQ1L6U9 139 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 INF2Q27J81 1249 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MCTP1Q6DN14 999 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CCDC174Q6PII3 467 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 JAMLQ86YT9 394 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 DRC7Q8IY82 874 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 UBR7Q8N806 425 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PANK1Q8TE04 598 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 USP6NLQ92738 828 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF341Q9BYN7 854 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CASS4Q9NQ75 786 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MCM3APO60318 1980 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 LCTP09848 1927 aa4.58□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MYH8P13535 1937 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CXCL11O14625 94 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 WNT9AO14904 365 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 GSTA4O15217 222 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 NPHS1O60500 1241 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MSCO60682 206 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM163BP0C2L3 166 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CAPN2P17655 700 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 GRK2P25098 689 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ITGB8P26012 769 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 GRK3P35626 688 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 KCNJ4P48050 445 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 TERF1P54274 439 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MAP3K12Q12852 859 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 DUSP4Q13115 394 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 IKZF1Q13422 519 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CCL14Q16627 93 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 MBLAC2Q68D91 279 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 ZPBP2Q6X784 338 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 FERMT3Q86UX7 667 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 KIF18BQ86Y91 864 aa4.57□□□□□ -1.68
CYCSP43-201ENST00000438233 CPNE8Q86YQ8 564 aa4.57□□□□□ -1.68
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