RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 CFAP69A5D8W1 941 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 PDGFRBP09619 1106 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 TYK2P29597 1187 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 PPP2R2AP63151 447 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF543Q08ER8 600 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 USP33Q8TEY7 942 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 MTA3Q9BTC8 594 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF235Q14590 738 aa18.18■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 MYBP10242 640 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ARL8AQ96BM9 186 aa18.18■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 CHP1Q99653 195 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 HOXD10P28358 340 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ERFP50548 548 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 RAET1EQ8TD07 263 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 KCNN4O15554 427 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 HAUS5O94927 633 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ATICP31939 592 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 PGBD4Q96DM1 585 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 WDR24Q96S15 920 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 PHF20Q9BVI0 1012 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 CRB1P82279 1406 aa18.17■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 CEP19Q96LK0 163 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF560Q96MR9 790 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 CASS4Q9NQ75 786 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF609O15014 1411 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 ARFIP2P53365 341 aa18.17■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 SUFUQ9UMX1 484 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 CDK17Q00537 523 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 COBLL1Q53SF7 1204 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 RALAP11233 206 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 EFNA5P52803 228 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 FBXW4P57775 412 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 TPI1P60174 286 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 GGT7Q9UJ14 662 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 NR1H3Q13133 447 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 TRIM72Q6ZMU5 477 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 RTN2O75298 545 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 GMNCA6NCL1 334 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 FAM161BQ96MY7 647 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 LRRC37BQ96QE4 947 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 LRRC1Q9BTT6 524 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 TMED1Q13445 227 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.53e-6■■■■□ 20.7
PTPRF-209ENST00000438120 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 APPL2Q8NEU8 664 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 TNIP3Q96KP6 325 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 PDIA5Q14554 519 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRF-209ENST00000438120 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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