RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 ALG6Q9Y672 507 aa14.73□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GGPS1O95749 300 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ITGA4P13612 1032 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 NAMPTP43490 491 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SOX10P56693 466 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FMO1Q01740 532 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 MTMR3Q13615 1198 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SV2AQ7L0J3 742 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GPC2Q8N158 579 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 LCTP09848 1927 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FAM187AA6NFU0 413 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ATG7O95352 703 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 CYP1A2P05177 515 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 RFC5P40937 340 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PSMD6Q15008 389 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 DEPTORQ8TB45 409 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 SEC14L1Q92503 715 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 ZNF653Q96CK0 615 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FNBP1Q96RU3 617 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 AMACRQ9UHK6 382 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 FZD1Q9UP38 647 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS3-202ENST00000428962 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 KIF3CO14782 793 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 PIGRP01833 764 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 MMEP08473 750 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 ECHS1P30084 290 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 WDR44Q5JSH3 913 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 TRIM11Q96F44 468 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 PORCNQ9H237 461 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 SIP14410 1827 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 TTI1O43156 1089 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 KRT5P13647 590 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 BPIFB4P59827 614 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 CLDN10P78369 228 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 DR1Q01658 176 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 MESDQ14696 234 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 TTMPQ5BVD1 217 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 LBX2Q6XYB7 198 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 ZNF677Q86XU0 584 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 ALG3Q92685 438 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 NUP85Q9BW27 656 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 PPME1Q9Y570 386 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 ERLIN2O94905 339 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 COMTP21964 271 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 CTNNA2P26232 953 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 GBP1P32455 592 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 PLVAPQ9BX97 442 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 PLAAQ9Y263 795 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 GLTPD2A6NH11 291 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS3-202ENST00000428962 DAPK3O43293 454 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms