RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 BICD1Q96G01 975 aa22.75■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 GBP3Q9H0R5 595 aa22.75■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 RNF39Q9H2S5 420 aa22.75■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 SPG21Q9NZD8 308 aa22.75■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 LZTS1Q9Y250 596 aa22.75■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 KLRC4O43908 158 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 AKAP5P24588 427 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PLCB3Q01970 1234 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 KRT17Q04695 432 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 CAMK4Q16566 473 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 POF1BQ8WVV4 589 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 RMND1Q9NWS8 449 aa22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 COL6A3P12111 3177 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TOM1L1O75674 476 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 RECQL4O94761 1208 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 POMCP01189 267 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 MCF2P10911 925 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PBX3P40426 434 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 SCNN1GP51170 649 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 GRIK3Q13003 919 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 NFKBIBQ15653 356 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM169Q96HH4 297 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 ZFP42Q96MM3 310 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TCHPQ9BT92 498 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 CDT1Q9H211 546 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TBX20Q9UMR3 447 aa22.73■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PROZP22891 400 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 KCNB1Q14721 858 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 HVCN1Q96D96 273 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 GSDMAQ96QA5 445 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 FIZ1Q96SL8 496 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TLR9Q9NR96 1032 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 SNTG2Q9NY99 539 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.72■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 CSPG5O95196 566 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 GCNT3O95395 438 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 GRM5P41594 1212 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 LIG4P49917 911 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 EHHADHQ08426 723 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PSMD2Q13200 908 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 ALCAMQ13740 583 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 KLK14Q9P0G3 267 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 THEGQ9P2T0 379 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 GDAQ9Y2T3 454 aa22.71■■□□□ 1.23
C4orf48-201ENST00000409248 RHOBTB3O94955 611 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 PIGRP01833 764 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 GALTP07902 379 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJB1P25685 340 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 SLC11A1P49279 550 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 GTF2BQ00403 316 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB33Q86T24 672 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 SPATA20Q8TB22 786 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 STK39Q9UEW8 545 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.7■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 ABLIM1O14639 778 aa22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 CLDN3O15551 220 aa22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 DDHD2O94830 711 aa22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 DSC1Q08554 894 aa22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 CAMK1Q14012 370 aa22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
C4orf48-201ENST00000409248 HPS3Q969F9 1004 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms