RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395925.7

GLI3-201, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GLI3, Length 8,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-201ENST00000395925 ST8SIA6P61647 398 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 NR1H3Q13133 447 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 UBE2SQ16763 222 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 VN1R5Q7Z5H4 357 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ZBED8Q8IZ13 594 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ADI1Q9BV57 179 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 RWDD2AQ9UIY3 292 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 RAD17O75943 681 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 HNMTP50135 292 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PKP1Q13835 747 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 CASP8Q14790 479 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 VEPH1Q14D04 833 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ZNF667Q5HYK9 610 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ELMO2Q96JJ3 720 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PARD6BQ9BYG5 372 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 MYH3P11055 1940 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 HPGDP15428 266 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ZNF699Q32M78 642 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SARM1Q6SZW1 724 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 OOSP2Q86WS3 158 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 DGKHQ86XP1 1220 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 CLDN3O15551 220 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 CYP27A1Q02318 531 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PWP1Q13610 501 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ADAM22Q9P0K1 906 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ADAM30Q9UKF2 790 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 COX10Q12887 443 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 EPB42P16452 691 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PIGOQ8TEQ8 1089 aa13□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 TALDO1P37837 337 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SLC30A9Q6PML9 568 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 CDH24Q86UP0 819 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 C11orf74Q86VG3 221 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 AKT1P31749 480 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 GREM2Q9H772 168 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 RSPH10BP0C881 870 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 OLFML2BQ68BL8 750 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 FLAD1Q8NFF5 587 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ING3Q9NXR8 418 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 HUS1O60921 280 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 HIST1H2ADP20671 130 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 THNSL1Q8IYQ7 743 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PPM1NQ8N819 430 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PIGSQ96S52 555 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 HIST1H2AJQ99878 128 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 H2AFJQ9BTM1 129 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 USP44Q9H0E7 712 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 COPG2Q9UBF2 871 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 FEN1P39748 380 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 COBLL1Q53SF7 1204 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 TCEAL5Q5H9L2 206 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 TAF8Q7Z7C8 310 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 POMGNT2Q8NAT1 580 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 CAPN10Q9HC96 672 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SERPINB13Q9UIV8 391 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PNMA3Q9UL41 463 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 A0A087X0T9 212 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 DFFAO00273 331 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ARMCX4Q5H9R4 360 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 COQ6Q9Y2Z9 468 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 XDHP47989 1333 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 AKAP10O43572 662 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PALMO75781 387 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 GPS1Q13098 491 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 C6orf10Q5SRN2 563 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SPON2Q9BUD6 331 aa12.99□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 PIPSLA2A3N6 862 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 CYBBP04839 570 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 KCNA6P17658 529 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 KDELC2Q7Z4H8 507 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 OLFM1Q99784 485 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 KANSL2Q9H9L4 492 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 ASNSD1Q9NWL6 643 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 LCMT1Q9UIC8 334 aa12.98□□□□□ -0.33
GLI3-201ENST00000395925 SPACA6W5XKT8 324 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms