RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342784.6

SYDE1-201, Transcript of synapse defective Rho GTPase homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SYDE1, Length 3,264 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1-201ENST00000342784 FOXN2P32314 431 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 KCNJ1P48048 391 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 TMED2Q15363 201 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 KYNUQ16719 465 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 TTC30AQ86WT1 665 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 OLFM3Q96PB7 478 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.61□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.61□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 ZBTB16Q05516 673 aa14.6□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 C6orf50Q9HD87 102 aa14.6□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 ITGB4P16144 1822 aa14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 CCDC125Q86Z20 511 aa14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 TBCKQ8TEA7 893 aa14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 ALG3Q92685 438 aa14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.6□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.6□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 LIN52Q52LA3 116 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 GATA6Q92908 595 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 ECE2O60344 883 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 CDH16O75309 829 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 TNFAIP3P21580 790 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 GNA11P29992 359 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 CCNFP41002 786 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 AP1B1Q10567 949 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.072e-8■■□□□ 12.1
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SYDE1-201ENST00000342784 ART4Q93070 314 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 BARHL2Q9NY43 387 aa14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 TBX10O75333 385 aa14.58□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 T-ENOLP0DO92 83 aa14.58□□□□□ -0.07
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SYDE1-201ENST00000342784 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 GJB7Q6PEY0 223 aa14.58□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 RFX8Q6ZV50 586 aa14.58□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.58□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.58□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SYDE1-201ENST00000342784 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.58□□□□□ -0.07
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