RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 RDH13Q8NBN7 331 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SLC35C1Q96A29 364 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SAAL1Q96ER3 474 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 NUP58Q9BVL2 599 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MSCO60682 206 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KRT13P13646 458 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 BDNFP23560 247 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PHKA2P46019 1235 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCZ1BP86790 482 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 BFSP1Q12934 665 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GPD1LQ8N335 351 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TSKSQ9UJT2 592 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MFAP3LO75121 409 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ADRB2P07550 413 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ADAM17P78536 824 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KCNMA1Q12791 1236 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MAPK6Q16659 721 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 C7orf31Q8N865 590 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FBXL18Q96ME1 805 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FZD8Q9H461 694 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.56□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 A0A087WZ62 844 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 EXTL3O43909 919 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PPFIA2O75334 1257 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 INHAP05111 366 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HOXC8P31273 242 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GPC3P51654 580 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 VAMP7P51809 220 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZPBP2Q6X784 338 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CNGA4Q8IV77 575 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 NLRP7Q8WX94 980 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 IQCDQ96DY2 449 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PANX2Q96RD6 677 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CENPOQ9BU64 300 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ETAA1Q9NY74 926 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQJ5 194 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TTC26A0AVF1 554 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GNAT1P11488 350 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CYP2C9P11712 490 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HSPA6P17066 643 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 DLG4P78352 724 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KCNA10Q16322 511 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FAM187BQ17R55 369 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FIGNQ5HY92 759 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZNF410Q86VK4 478 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TSC1Q92574 1164 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCDC51Q96ER9 411 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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