RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.64■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.64■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GDF3Q9NR23 364 aa24.64■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 EDN1P05305 212 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 FMO1Q01740 532 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 DRP2Q13474 957 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 IFT20Q8IY31 132 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GZMAP12544 262 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 EPHX2P34913 555 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GYS2P54840 703 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GPC5P78333 572 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CAPSQ13938 189 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 FNBP1Q96RU3 617 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.63■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 RAD51CO43502 376 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 TNNI1P19237 187 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 EPHB4P54760 987 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 FAM193AP78312 1265 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GUCY2DQ02846 1103 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 TCEAL1Q15170 157 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 AZI2Q9H6S1 392 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ESYT3A0FGR9 886 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
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SNX18-201ENST00000326277 GCNT1Q02742 428 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 KCTD2Q14681 263 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 MMP19Q99542 508 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GPR20Q99678 358 aa24.62■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.62■■□□□ 1.53
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SNX18-201ENST00000326277 COPB2P35606 906 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CDR2Q01850 454 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ZACNQ401N2 412 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
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SNX18-201ENST00000326277 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 MED4Q9NPJ6 270 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 PTPRJQ12913 1337 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 A0A0B4J269 797 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ADCY3O60266 1144 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 DCAF12L1Q5VU92 463 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 EMBQ6PCB8 327 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 TRIM50Q86XT4 487 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 FAM71BQ8TC56 605 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GLG1Q92896 1179 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 VPS18Q9P253 973 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 KRIT1O00522 736 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 KRT5P13647 590 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 WDR78Q5VTH9 848 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 FAM167AQ96KS9 214 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ALG6Q9Y672 507 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 HLA-DRAP01903 254 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 NFU1Q9UMS0 254 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ITGA4P13612 1032 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.58■■□□□ 1.53
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