RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2N-201ENST00000318066 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
UBE2N-201ENST00000318066 EMSYQ7Z589 1322 aa20.08■□□□□ 0.81
UBE2N-201ENST00000318066 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 HOMEZQ8IX15 550 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CDC42EP1Q00587 391 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CPDO75976 1380 aa20.08■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 E5RI56 91 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CASP1P29466 404 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 PTK2BQ14289 1009 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 STX19Q8N4C7 294 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CEP95Q96GE4 821 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 TNIP3Q96KP6 325 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L15C9J2P7 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L11C9JVI0 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L18D6R9N7 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L22D6RA61 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L19D6RCP7 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L20D6RJB6 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 POU5F1BQ06416 359 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L24Q0WX57 530 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 KRT33BQ14525 404 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 P3H1Q32P28 736 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 PASD1Q8IV76 773 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 PCDHGB4Q9UN71 923 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 MED14O60244 1454 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 KCNQ4P56696 695 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ANKRD7Q92527 254 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 LXNQ9BS40 222 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 COG4Q9H9E3 785 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 LAMC1P11047 1609 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 P4HA2O15460 535 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 KITP10721 976 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CDH6P55285 790 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CD209Q9NNX6 404 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 KRT8P05787 483 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 GUCY1A3Q02108 690 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 RAD51Q06609 339 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 NR1I3Q14994 352 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 NARFQ9UHQ1 456 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 HSD17B4P51659 736 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 NAB2Q15742 525 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 C16orf89Q6UX73 402 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 POTEFA5A3E0 1075 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L10C9JJH3 530 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ESRRBO95718 433 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 POTEIP0CG38 1075 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 ARPP19P56211 112 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CUL3Q13618 768 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 POTEGQ6S5H5 508 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 RNF217Q8TC41 542 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 EPAS1Q99814 870 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 SUFUQ9UMX1 484 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 TTLL4Q14679 1199 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2N-201ENST00000318066 CNGA3Q16281 694 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms