RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.45■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 BRD1O95696 1058 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 CDT1Q9H211 546 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 C11orf16Q9NQ32 467 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 DZANK1Q9NVP4 752 aa24.44■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 SLC16A4O15374 487 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 URODP06132 367 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 THP07101 528 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 EPCAMP16422 314 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 CA8P35219 290 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 DSG1Q02413 1049 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ITIH3Q06033 890 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.43■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 GPR37L1O60883 481 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ALADP13716 330 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 PLCG1P19174 1290 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 GRM5P41594 1212 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 GLUD2P49448 558 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 CLCN4P51793 760 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 XKR4Q5GH76 650 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 FUT10Q6P4F1 479 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 DCXO43602 365 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 STX6O43752 255 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF131P52739 623 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 SMTNP53814 917 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 NCKAP1LP55160 1127 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 CEP120Q8N960 986 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 RAD54LQ92698 747 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 GDAQ9Y2T3 454 aa24.41■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 C1RP00736 705 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 MCF2P10911 925 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 USP49Q70CQ1 688 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 RNF135Q8IUD6 432 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 REEP2Q9BRK0 252 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 APOL5Q9BWW9 433 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.4■■□□□ 1.5
PRADC1-201ENST00000258083 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 TEX28O15482 410 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 TOM1L1O75674 476 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 KLRC2P26717 231 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 USP41Q3LFD5 358 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 CES5AQ6NT32 575 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 ZPBP2Q6X784 338 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 GPBP1Q86WP2 473 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 RABGGTAQ92696 567 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 EPSTI1Q96J88 318 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 FBXL18Q96ME1 805 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 USP28Q96RU2 1077 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 CDH22Q9UJ99 828 aa24.39■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 C2CD2LO14523 706 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 KIF4AO95239 1232 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 ADH1AP07327 375 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 SCP2P22307 547 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 DDIT3P35638 169 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 STRN3Q13033 797 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 MCM6Q14566 821 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM31Q5JXX7 168 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 LRFN3Q9BTN0 628 aa24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
PRADC1-201ENST00000258083 FNIP2Q9P278 1114 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms