RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113889.8

Gtf3c5-202, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Jade3Q6IE82 823 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gpr156Q6PCP7 798 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fermt3Q8K1B8 665 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Atp6v0a4Q920R6 833 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Psmd6Q99JI4 389 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 ArpinQ9D0A3 226 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Calr3Q9D9Q6 380 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cst12Q9DAN8 128 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rtn3Q9ES97 964 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cul1Q9WTX6 776 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gm4846B2RWH8 538 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tspyl3Q3UYP3 334 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pick1Q62083 416 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Micall1Q8BGT6 870 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rnf25Q9QZR0 456 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Sbno2Q7TNB8 1349 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Brca1P48754 1812 aa14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tnfrsf18O35714 228 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 RargP18911 458 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ttc39dQ0VF76 604 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Trappc3lQ4KL14 181 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Abi3bpQ59IW6 1179 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ndufaf2Q59J78 168 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 SpopQ6ZWS8 374 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fgd5Q80UZ0 1219 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Trim6Q8BGE7 488 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ccdc15Q8C9M2 810 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mov10l1Q99MV5 1187 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cnot8Q9D8X5 292 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 IdeQ9JHR7 1019 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ngly1Q9JI78 651 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Prdm12A2AJ77 365 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Myo1eE9Q634 1107 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Capn2O08529 700 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ifnb1P01575 182 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ccnd3P30282 292 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Vav2Q60992 868 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Dsg1aQ61495 1057 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gm5622Q810Q0 167 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lrrc4cQ8C031 640 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lrrc45Q8CIM1 670 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Dpp7Q9ET22 506 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Zgrf1Q0VGT4 1863 aa14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gm4297D3YWB7 211 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 E9QMW4 1145 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Taf4bG5E8Z2 855 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 MafgO54790 162 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tulp2P46686 562 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tnni3P48787 211 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Adgre1Q61549 931 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ddr2Q62371 854 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Moxd2Q7TT41 619 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 B3glctQ8BHT6 489 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Scrn2Q8VCA8 425 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Olfr390Q8VEZ7 311 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rab11fip1Q9D620 645 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mta2Q9R190 668 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Znf804aA2AKY4 1200 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mmrn2A6H6E2 943 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 GclmO09172 274 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Clk2O35491 499 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Klra1P20937 262 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tbx3P70324 741 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Grm2Q14BI2 872 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gm3414Q3TNU4 584 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Wdr41Q3UDP0 460 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gm10392Q3V3I3 114 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ccdc125Q5U465 500 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 A1cfQ5YD48 595 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mkrn3Q60764 544 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Zbtb17Q60821 794 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Git1Q68FF6 770 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Dzip3Q7TPV2 1204 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gcfc2Q8BKT3 769 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Slc12a9Q99MR3 914 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Slc40a1Q9JHI9 570 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ggps1Q9WTN0 300 aa14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Timm44O35857 452 aa14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cops5O35864 334 aa14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 FlgP11088 336 aa14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Nub1P54729 614 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60 ms