RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm4756A0A140LIS8 335 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnq1P97414 668 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mpp4Q6P7F1 635 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tspan18Q80WR1 248 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cep128Q8BI22 1102 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbm41Q8JZV4 413 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plekha5E9Q6H8 1269 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lmod3E9QA62 571 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Akr1b1P45376 316 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AdssP46664 456 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcsk1P63239 753 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nrp1P97333 923 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem109Q3UBX0 243 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kpna1Q60960 538 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Akap7Q7TN79 314 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr23Q7TRX4 325 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Spata32Q8C5V0 334 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 OgtQ8CGY8 1046 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrrc71Q9D3W5 558 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Htatip2Q9Z2G9 242 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Efcab12V9GXH0 673 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Piezo2Q8CD54 2822 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myo16Q5DU14 1919 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Taf4bG5E8Z2 855 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sox1P53783 391 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tbx3P70324 741 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adcy6Q01341 1165 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 March5Q3KNM2 278 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smcr8Q3UMB5 935 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 E2f7Q6S7F2 904 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GnsQ8BFR4 544 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp37Q8C0R0 979 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rpp40Q8R1F9 363 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zmat2Q9CPW7 199 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Oxct1Q9D0K2 520 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gde1Q9JL56 331 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Grb14Q9JLM9 538 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr456B2RT27 312 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fgfr1P16092 822 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ndufs6P52503 116 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NrlP54846 237 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sox9Q04887 507 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 R3hdm4Q4VBF2 262 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Txndc16Q7TN22 820 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rint1Q8BZ36 792 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Castor2Q8CAB8 329 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc71Q8VEG0 433 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr458Q8VF80 313 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr457Q8VGP5 313 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mfsd5Q921Y4 450 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Brms1Q99N20 246 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ribc1Q9D0B8 379 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pex11aQ9Z211 246 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pds5aQ6A026 1332 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Veph1A1A535 833 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bpifb4A2BGH0 617 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn2r79E9Q067 851 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TnfP06804 235 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adcyap1r1P70205 496 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp11bQ6DFW5 1175 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q8BGN9 141 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gpc5Q8CAL5 572 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wdr24Q8CFJ9 790 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Frat2Q8K025 231 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PrameQ9D4Z5 464 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chst7Q9EP78 484 aa21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyth3O08967 399 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PtgisO35074 501 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TertO70372 1122 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 mt-Co3P00416 261 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DhpsQ3TXU5 369 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Foxn3Q499D0 457 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mxd4Q60948 209 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fkbp3Q62446 224 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf507Q6ZPY5 941 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sdccag8Q80UF4 717 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Extl1Q9JKV7 669 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cpsf3Q9QXK7 684 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Large1Q9Z1M7 756 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prl6a1O35257 230 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp10P52479 792 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim43cP86449 446 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CybbQ61093 570 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf235Q61116 645 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ttc26Q8BS45 554 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GancQ8BVW0 898 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pde5aQ8CG03 865 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms