RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047830.7

Hoxd3-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd3, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 PctpP53808 214 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tm4sf1Q64302 202 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Slc26a6Q8CIW6 758 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Isl2Q9CXV0 359 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 PycardQ9EPB4 193 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gm1141B9EJU1 475 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Pitpnm1O35954 1243 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 PdgfaP20033 211 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Klhdc9Q3USL1 350 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 ClasrpQ8CFC7 668 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tlr5Q9JLF7 859 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Scn9aQ62205 1984 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Oip5A2AQ14 241 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Unc13dB2RUP2 1085 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gm7995L7N2E4 160 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Eno1P17182 434 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Irf8P23611 424 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ugt1a2P70691 533 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Wdr41Q3UDP0 460 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Strip1Q8C079 837 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tom1l1Q923U0 474 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Capn15Q9JLG8 1095 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rnf103Q9R1W3 683 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Glt1d1A4FUP9 346 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Mroh5E9PUJ8 762 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Fgfr1P16092 822 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Smcr8Q3UMB5 935 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Zfp449Q8CB76 518 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rnf6Q9DBU5 667 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Birc5O70201 140 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Magea6O89010 325 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Kcnc2Q14B80 642 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rnf10Q3UIW5 804 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 FancbQ5XJY6 703 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rab44Q8CB87 725 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rsad2Q8CBB9 362 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 DmgdhQ9DBT9 869 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Scnn1bQ9WU38 638 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa20.22■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Idh1O88844 414 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 IvlP48997 467 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Aars2Q14CH7 980 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Acot6Q32Q92 419 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gm5168Q4KL04 211 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Vmn1r209Q5NC97 312 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 PolnQ7TQ07 864 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 PhkbQ7TSH2 1085 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rusc1Q8BG26 893 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ropn1Q9ESG2 212 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Slc8a3S4R2P9 928 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Mia3Q8BI84 1930 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Klhdc7aA2APT9 773 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Xrcc5P27641 732 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Mybl2P48972 704 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rasgrf2P70392 1189 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Fbln1Q08879 705 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Jade3Q6IE82 823 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tas2r134Q7TQB0 298 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Oxnad1Q8VE38 311 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 MgarpQ8VI64 283 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tgm5Q9D7I9 724 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Znf354bQ9QXT9 601 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Azi2Q9QYP6 405 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gm13084A2A8N0 494 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Bfsp1A2AMT1 669 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 MipepA6H611 711 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Lonrf2B2RT44 518 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 4933406M09RikG3XA12 479 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Cyp11b2P15539 500 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Pik3caP42337 1068 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 RalgdsQ03385 852 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gstt2Q61133 244 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Xlr3cQ61806 226 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 TbataQ7TSD4 393 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Nemp2Q8CB65 421 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Zbtb44Q8R0A2 453 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gmcl1Q920G9 524 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Akt1s1Q9D1F4 257 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Terb2Q9D494 218 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Myl1P05977 188 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Kif5aP33175 1027 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ppp3caP63328 521 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Psd3Q2PFD7 1037 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.6 ms