RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc16a6B1AT66 607 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sclt1G5E861 688 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scgb2b19J3QM75 112 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nck2O55033 380 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stat4P42228 749 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrgprb8Q7TN51 330 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iqcb1Q8BP00 598 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tlr3Q99MB1 905 aa12.67□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec14l1A8Y5H7 715 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Unc13dB2RUP2 1085 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp3P28862 477 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pla2g4aP47713 748 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ap5z1Q3U829 807 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hspa4Q61316 841 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Six2Q62232 296 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vat1lQ80TB8 417 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Qsox1Q8BND5 748 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stap2Q8R0L1 411 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmco4Q91WU4 631 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klra17Q9JMA4 273 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Efcab12V9GXH0 673 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pds5aQ6A026 1332 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttc13A0A1L1SSC7 844 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r53L7N473 806 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnu1O54982 1121 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 GlrbP48168 496 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sorbs1Q62417 1290 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh3gl1Q62419 368 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hnrnph3D3Z3N4 346 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm20503G3UZK1 150 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scp2P32020 547 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scarf2P59222 833 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf865Q3U3I9 1058 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdk17Q8K0D0 523 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps18Q8R307 973 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2sQ921J4 223 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem39aQ9CYC3 486 aa12.66□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekha5E9Q6H8 1269 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gnrh1P13562 90 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mapk6Q61532 720 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmco3Q8BH01 678 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arfgap2Q99K28 520 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnq4Q9JK97 696 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kng1O08677 661 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aoc3O70423 765 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cetn1P41209 172 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 HarsQ61035 509 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mettl25Q6NXH8 597 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snx17Q8BVL3 470 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tubb4aQ9D6F9 444 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cpsf3Q9QXK7 684 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adam22Q9R1V6 904 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r121A2BE32 847 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt13P08730 437 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ano7Q14AT5 859 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oas1fQ14AZ4 364 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Upf3bQ3ULL6 472 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam198aQ3UY90 562 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Maats1Q8BRC6 783 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phtf2Q8CB19 747 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxo43Q8CDI2 640 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdha2Q91Y17 948 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mzb1Q9D8I1 188 aa12.65□□□□□ -0.38
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp27b1O35084 507 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 IkbkbO88351 757 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2c38P56655 490 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim72Q1XH17 477 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Muc3aQ3U5A2 218 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ntan1Q64311 310 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 WhrnQ80VW5 918 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina3bQ8BYY9 420 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rint1Q8BZ36 792 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ap3m2Q8R2R9 418 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scrn2Q8VCA8 425 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr393Q8VGR6 312 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trmt10bQ9D075 318 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Osbpl7A2A716 963 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prdm12A2AJ77 365 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptchd4B9EKX1 904 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r15L7N2A0 855 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2afzP0C0S6 128 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gfpt1P47856 697 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2afvQ3THW5 128 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mysm1Q69Z66 819 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrig3Q6P1C6 1117 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Celf4Q7TSY6 486 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hook3Q8BUK6 718 aa12.64□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc7a14Q8BXR1 771 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.8 ms