RNA–Protein interactions for RNA: YML034W

SRC1, Transcript of Inner nuclear membrane protein, yeast

Gene SRC1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRC1	YML034W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PRE8	P23639	250 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YCR102C	P25608	368 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRPL15	P36523	253 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YBR241C	P38142	488 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ARP1	P38696	384 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YEL068C	P39977	110 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ATM1	P40416	690 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YIL060W	P40519	144 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GLC8	P41818	229 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YGR201C	P42936	225 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MTQ1	P53944	314 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRP51	Q02950	344 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ODC1	Q03028	310 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TDA1	Q03533	586 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RNH202	Q05635	350 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ECM7	Q06200	448 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CSI2	Q08054	341 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	HRD1	Q08109	551 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MHT1	Q12525	324 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	AFI1	Q99222	893 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GAL80	P04387	435 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NAM2	P11325	894 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RBK1	P25332	333 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YCR043C	P25361	127 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRP4	P32902	394 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRPL28	P36527	147 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	HAT2	P39984	401 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ATG18	P43601	500 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SWC4	P53201	476 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	VOA1	P53262	265 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YNL234W	P53857	426 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	KTR6	P54070	446 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TIM8	P57744	87 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NUP116	Q02630	1113 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YDC1	Q02896	317 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YPL257W	Q08974	193 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ERP3	Q12403	225 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MYO1	P08964	1928 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	FAB1	P34756	2278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RPB8	P20436	146 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GRR1	P24814	1151 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	BUB3	P26449	341 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ROT2	P38138	954 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MBA1	P38300	278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ELO1	P39540	310 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	LCB2	P40970	561 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	VMA21	P41806	77 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	LOH1	P47055	219 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRX6	P48564	524 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YGL185C	P53100	379 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	COG7	P53195	279 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YNL181W	P53878	407 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ZRC1	P20107	442 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GID7	P25569	745 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	POF1	P25576	258 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	URA10	P30402	227 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CSG2	P35206	410 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRPL4	P36517	319 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	AVT5	P38176	459 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	FMP23	P38231	175 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YBR220C	P38318	560 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ANS1	P38832	159 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MDM31	P38880	579 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PHO90	P39535	881 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GAT2	P40209	560 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PAM16	P42949	149 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YAR1	P46683	200 aa		2.75	□□□□□ -1.97

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