RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTR2	YKR093W	CTF19	Q02732	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	VPS60	Q03390	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	MHR1	Q06630	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	POX1	P13711	748 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	APA2	P22108	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	CMK2	P22517	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	PEX3	P28795	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YBR096W	P38256	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	ASI3	P53983	676 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YCT1	Q12235	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	ATG15	P25641	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	MBA1	P38300	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YNL194C	P40169	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	JEN1	P36035	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	WSC4	P38739	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	MIG3	P39943	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	BOR1	P53838	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	MMT2	Q08970	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	CDC50	P25656	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	STB1	P42845	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YCR025C	P25352	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	TAF14	P35189	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	MRPL10	P36520	322 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	SOL2	P37262	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	MED8	P38304	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	VIK1	Q12045	647 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTR2	YKR093W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	COX15	P40086	486 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	RNH201	P53942	307 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	RMI1	Q02685	241 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	FRM2	P37261	193 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	OM14	P38325	134 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	SDC1	Q03323	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	CDC123	Q05791	360 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	NUP170	P38181	1502 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	CBF1	P17106	351 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	MRP21	P38175	177 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	AVT7	P40501	490 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	MRX11	Q03079	207 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	PLB3	Q08108	686 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YKL075C	P36083	450 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	CUE1	P38428	203 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	EFM1	P38732	585 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YGL260W	P53056	76 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	COQ10	Q08058	207 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	RAD9	P14737	1309 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
PTR2	YKR093W	SEN34	P39707	275 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	COG7	P53195	279 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	LIP2	Q06005	328 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	SWD3	P38123	315 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	GOS1	P38736	223 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	GAB1	P41733	394 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PTR2	YKR093W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.3 ms