RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	YCR043C	P25361	127 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	NAM9	P27929	486 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	SSO1	P32867	290 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	MNS1	P32906	549 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	PMU1	P36069	295 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	RTC2	P38279	296 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	YHR122W	P38829	231 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	AIM2	P39721	246 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	SIM1	P40472	476 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	PMT4	P46971	762 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	SFH5	P47008	294 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	TOS2	P50078	622 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	SUR7	P54003	302 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	CAB5	Q03941	241 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	SMP3	Q04174	516 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	TPO4	Q12256	659 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	JLP1	Q12358	412 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	SNF8	Q12483	233 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	SAS5	Q99314	248 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	STE7	P06784	515 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	UNG1	P12887	359 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	ATR1	P13090	542 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	CCA1	P21269	546 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	YHR218W	P38899	603 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	YIL001W	P40560	513 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	CUP9	P41817	306 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	NAS6	P50086	228 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	CDH1	P53197	566 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	ECM11	Q04110	302 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	AKR2	Q12013	749 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	GET4	Q12125	312 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CIA2	YHR122W	MRS3	P10566	314 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	NAT2	P37293	288 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	CHK1	P38147	527 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	FAA2	P39518	744 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	AYR1	P40471	297 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PHB1	P40961	287 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPN14	P53196	417 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	VOA1	P53262	265 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	GOR1	P53839	350 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	GMC2	Q06201	188 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	AYT1	Q12226	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YRM1	Q12340	786 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	SET6	Q12529	373 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	CAP2	P13517	287 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	GPI12	P23797	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PMT2	P31382	759 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	ATS1	P31386	333 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YPS1	P32329	569 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YEF1	P32622	495 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	FRT2	P39734	528 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YND1	P40009	630 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	ICE2	P40499	491 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	SRL1	Q08673	210 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RAX1	Q08760	435 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPN6	Q12377	434 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	UGA1	P17649	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	TOA2	P32774	122 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
CIA2	YHR122W	VPS51	P36116	164 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MRPL17	P36528	281 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MIX23	P38162	196 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	FES1	P38260	290 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	GEP4	P38812	185 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	TDA11	P38854	504 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	HPM1	P40481	377 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPR2	P40571	144 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	USE1	P53146	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YGR067C	P53243	804 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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