RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	SWM1	Q12379	170 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.49	□□□□□ -0.25	not detected
RTC3	YHR087W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	PPG1	P32838	368 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YHR122W	P38829	231 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	SYG1	P40528	902 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	CAT5	P41735	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	MRPL50	P53724	139 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YLR283W	Q05867	314 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	NNT1	Q05874	261 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	MDM30	Q05930	598 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	MCH4	Q08268	501 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	RPL43B	P0CX26	92 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	RPC34	P32910	317 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	GPG1	P53130	126 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	ATG21	Q02887	496 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	MDM32	Q12171	622 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YAL064W-B	O13512	126 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	SCEI	P03882	235 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	CHO1	P08456	276 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	STE18	P18852	110 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	AGE1	Q04412	482 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.46	□□□□□ -0.25	not detected
RTC3	YHR087W	ORT1	Q12375	292 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	FSH3	Q99369	266 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SIT1	P39980	628 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	GAS2	Q06135	555 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	TGS1	Q12052	315 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	MCM10	P32354	571 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	MKS1	P34072	584 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SLI1	P53304	468 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	ASI3	P53983	676 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	PET191	Q02772	108 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	HMS1	Q12398	434 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	YLR358C	O13565	187 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	ERG8	P24521	451 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SNC2	P33328	115 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	DLS1	P40366	167 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SAM50	P53969	484 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	RSC58	Q07979	502 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	RRI1	Q12468	440 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	CTA1	P15202	515 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SPO7	P18410	259 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.42	□□□□□ -0.26	not detected
RTC3	YHR087W	REE1	P40893	198 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	YIP4	P53093	235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	CTF19	Q02732	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	GIS1	Q03833	894 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	PDX1	P16451	410 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	UTR1	P21373	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	ERG4	P25340	473 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	FRM2	P37261	193 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	APL3	P38065	1025 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SHO1	P40073	367 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	PUG1	P40100	303 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	SLZ1	P40167	298 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	UBX6	P47049	396 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	POP6	P53218	158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	FMP48	P53233	369 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	PLP1	Q04004	230 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	DFG5	Q05031	458 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	YOR385W	Q08909	290 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	URA3	P03962	267 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	DBF20	P32328	564 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.4	□□□□□ -0.26	not detected
RTC3	YHR087W	FLO10	P36170	1169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	RRF1	P38771	230 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	YIL060W	P40519	144 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	NIT2	P47016	307 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	COA4	Q05809	96 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	RAX1	Q08760	435 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	FRE3	Q08905	711 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	RDI1	Q12434	202 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RTC3	YHR087W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RTC3	YHR087W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RTC3	YHR087W	PET18	P25362	215 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RTC3	YHR087W	COS9	P36034	407 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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