RNA–Protein interactions for RNA: YBL058W

SHP1, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene SHP1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHP1	YBL058W	SPC2	Q04969	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	COX5B	P00425	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	SCEI	P03882	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	BOS1	P25385	244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	FAT1	P38225	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	QRI7	P43122	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YFL054C	P43549	646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	SSY5	P47002	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YNL095C	P53932	642 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	ASI3	P53983	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	NUP49	Q02199	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	MSS11	Q03825	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	GTB1	Q04924	702 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PIN3	Q06449	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	RRI1	Q12468	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	STE18	P18852	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	SNF6	P18888	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	CLB4	P24871	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	STE50	P25344	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	DAL3	P32459	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YBR241C	P38142	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	CHA4	P43634	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	ACL4	Q03771	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	SPC19	Q03954	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	OSW1	Q08692	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	UIP4	Q08926	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	ACF2	Q12168	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PDE2	P06776	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	BNA2	P47125	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	GEP7	P53171	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PRM8	P53174	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YNR064C	P53750	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PTP2	P29461	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	RPC82	P32349	654 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	TFC1	P32367	649 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YKR015C	P36111	568 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	BAP2	P38084	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	GPI18	P38211	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	SIC1	P38634	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YHR035W	P38769	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PTC7	P38797	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	LNP1	P38878	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	LOH1	P47055	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	YDC1	Q02896	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	NNT1	Q05874	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHP1	YBL058W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YCL002C	P25565	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RPC34	P32910	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SUR1	P33300	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	REC104	P33323	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	PRY2	P36110	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SPC34	P36131	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	CHL4	P38907	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SPO73	P40031	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	EXG2	P52911	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RSM23	Q01163	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	AIM36	Q03798	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ELP6	Q04868	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	MCH2	P36032	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ICS2	P38284	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SBE22	P38814	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	PHO90	P39535	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SIT1	P39980	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ATF1	P40353	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RMR1	P53060	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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