RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	TAD2	P47058	250 aa		2.79	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	ATC1	Q04005	294 aa		2.79	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	COX2	P00410	251 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	SDH4	P37298	181 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	PRM9	P39551	298 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	OST6	Q03723	332 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	NNT1	Q05874	261 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	SEC10	Q06245	871 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	CTR3	Q06686	241 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	HRT1	Q08273	121 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	YOL107W	Q12239	342 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	ATG5	Q12380	294 aa		2.78	□□□□□ -1.96
POP8	YBL018C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	KRE6	P32486	720 aa		2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	POP8	P38208	133 aa		2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	SER33	P40510	469 aa		2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	MNT4	P53745	580 aa		2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	BTS1	Q12051	335 aa		2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	PRR2	Q12310	699 aa		2.77	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	PHO89	P38361	574 aa		2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	TIM21	P53220	239 aa		2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	SDC1	Q03323	175 aa		2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YDR114C	Q04597	100 aa		2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	MRX4	Q12467	430 aa		2.76	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	MET2	P08465	486 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RSR1	P13856	272 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	PEX3	P28795	441 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YER084W	P40057	128 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YAR1	P46683	200 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	TVP15	Q03860	143 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	CTS2	Q06350	511 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YOS9	Q99220	542 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	PAN1	P32521	1480 aa		2.75	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	DAL82	P21705	255 aa		2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	SHC1	P39000	512 aa		2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	DDI1	P40087	428 aa		2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YGL088W	P53151	121 aa		2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	SWS2	P53937	143 aa		2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	DIA1	P54005	336 aa		2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YPR096C	O13587	100 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	MSF1	P08425	469 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	KRE1	P17260	313 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RRT12	P25381	491 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	MIG1	P27705	504 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	ERG2	P32352	222 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RPE1	P46969	238 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YJR012C	P47087	207 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	NBP35	P52920	328 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RSM27	P53305	110 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	MAL13	P53338	473 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YNL095C	P53932	642 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RRN5	Q02983	363 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	FEX1	Q08913	375 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	FEX2	Q08991	375 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.73	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	CWP1	P28319	239 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	COY1	P34237	679 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
POP8	YBL018C	HMT1	P38074	348 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	BIG1	P38813	335 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	OST3	P48439	350 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	MIG2	P53035	382 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YPL039W	Q03080	316 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	YPL150W	Q12152	901 aa		2.72	□□□□□ -1.97
POP8	YBL018C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.71	□□□□□ -1.98	not detected
POP8	YBL018C	YHL049C	P38722	271 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP8	YBL018C	ARN2	P38724	620 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP8	YBL018C	SUR2	P38992	349 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP8	YBL018C	IGO1	P53897	168 aa		2.71	□□□□□ -1.98
POP8	YBL018C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
POP8	YBL018C	STH1	P32597	1359 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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