RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635248.1

RABGAP1L-222, Transcript of RAB GTPase activating protein 1 like, human

TSL 5

Gene RABGAP1L, Length 3,074 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGAP1L-222	ENST00000635248	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	GNAT1	P11488	350 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ADAM17	P78536	824 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	MTF1	Q14872	753 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	WNT8B	Q93098	351 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RABGAP1L-222	ENST00000635248	GRIN2D	O15399	1336 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	EXTL3	O43909	919 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	KPNA6	O60684	536 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PON1	P27169	355 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ACLY	P53396	1101 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	LHX8	Q68G74	356 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	CNGA4	Q8IV77	575 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	DEFB118	Q96PH6	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	CHP1	Q99653	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	RNF19A	Q9NV58	838 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	NOD1	Q9Y239	953 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	FAM170A	A1A519	330 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	GPR32	O75388	356 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ABCD1	P33897	745 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	MYL7	Q01449	175 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	RNF208	Q9H0X6	261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	NRDC	O43847	1150 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	NOL4	O94818	638 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PIGR	P01833	764 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PTGIS	Q16647	500 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	AMHR2	Q16671	573 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	FBXL18	Q96ME1	805 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	CDT1	Q9H211	546 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	MXI1	P50539	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	BIRC3	Q13489	604 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	HES2	Q9Y543	173 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	PTPRJ	Q12913	1337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TSPAN1	O60635	241 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	THPO	P40225	353 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TRIM14	Q14142	442 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RABGAP1L-222	ENST00000635248	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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