RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHA7Q15375 998 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 USP41Q3LFD5 358 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf19Q8IY42 314 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 DYDC2Q96IM9 177 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKD2Q9BZL6 878 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNMB3Q9NPA1 279 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 RGL1Q9NZL6 768 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ14Q9UNX9 436 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NUMBLQ9Y6R0 609 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 EVCP57679 992 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4A11Q02928 519 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 STK3Q13188 491 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 TFDP1Q14186 410 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NPY5RQ15761 445 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NEK8Q86SG6 692 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR62Q9BZJ7 368 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST7Q9NS84 486 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GIT1Q9Y2X7 761 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 EFEMP2O95967 443 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 SP9P0CG40 484 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 PTENP60484 403 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CREMQ03060 361 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR4Q13639 388 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.472e-8■■□□□ 14
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf210Q8IVY1 113 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 RABGGTAQ92696 567 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXQ1Q9C009 403 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM28Q9UKQ2 775 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-217ENST00000629983 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 FSHRP23945 695 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP5P24588 427 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 FNIP2Q9P278 1114 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP2Q9UGN5 583 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ANHXE9PGG2 379 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB39O15060 712 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 TADA2AO75478 443 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYND10O75800 440 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 NPTXRO95502 500 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP4R3AQ6IN85 833 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 RUFY3Q7L099 469 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 TPH2Q8IWU9 490 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PJA1Q8NG27 643 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 RUBCNQ92622 972 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 SHDQ96IW2 340 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK14Q9P0G3 267 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 C1RP00736 705 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIK3Q13003 919 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 LIN9Q5TKA1 542 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 LILRA6Q6PI73 481 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 HAS1Q92839 578 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX3O15119 743 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRN2O75325 713 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 MBTD1Q05BQ5 628 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPSQ13938 189 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEDQ86YR6 584 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR65Q8IYL9 337 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 DCLK2Q8N568 766 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ASAP3Q8TDY4 903 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 POLIQ9UNA4 740 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.469e-10■■■■□ 24.3
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEMA6NI47 508 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 REC8O95072 547 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 BAG4O95429 457 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 GPC5P78333 572 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEGQ6S5H5 508 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 HASPINQ8TF76 798 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNG4Q9UBN1 327 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH7Q9ULB5 785 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1AO00555 2505 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-217ENST00000629983 DCHS1Q96JQ0 3298 aa30.39■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 B4GALT5O43286 388 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 KINO60870 393 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPLNO95428 1278 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-217ENST00000629983 XBP1P17861 261 aa30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms