RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CABP7Q86V35 215 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SFXN1Q9H9B4 322 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 DMXL1Q9Y485 3027 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CARNS1A5YM72 827 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM205CA6NFA0 338 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 LAD1O00515 517 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 PI15O43692 258 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 EFEMP2O95967 443 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 DNM2P50570 870 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP4Q96MN2 994 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 GBP3Q9H0R5 595 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 NPEPPSP55786 919 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FSIP1Q8NA03 581 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 VAV3Q9UKW4 847 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 HPSEQ9Y251 543 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FRYLO94915 3013 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF292O60281 2723 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC37A4O43826 429 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 RESP18Q5W5W9 173 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 TIGD1Q96MW7 591 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCH5Q9NX47 278 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-216ENST00000628306 NR1I2O75469 434 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMC5P62195 406 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP12Q9UNI6 340 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 AOC1P19801 751 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS1R1Q7RTX1 841 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 NEK8Q86SG6 692 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK12Q9HB15 430 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 NRP1O14786 923 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPHP41219 470 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGDRQ13258 359 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R5CQ13362 524 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TDGQ13569 410 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF174Q15697 407 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SHC4Q6S5L8 630 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOP3Q7RTS5 596 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PGBD4Q96DM1 585 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD1Q9H3U5 465 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RSAD1Q9HA92 442 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 KINO60870 393 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP2B1P20020 1258 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRC2P26717 231 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 LETM2Q2VYF4 491 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FLCNQ8NFG4 579 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM143Q96AN5 459 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 DOCK8Q8NF50 2099 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SYCE3A1L190 88 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 INPPL1O15357 1258 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 NARSO43776 548 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPLNO95428 1278 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 POMCP01189 267 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 INF2Q27J81 1249 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC105Q8IYK2 499 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 URGCPQ8TCY9 931 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TCHHQ07283 1943 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAH14Q0VDD8 3507 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SOD2P04179 222 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-216ENST00000628306 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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