RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PDE4DIP-241ENST00000616206 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARVCFO00192 962 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHGA12O60330 932 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 GH2P01242 217 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CKMP06732 381 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ASNSP08243 561 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ATP5JP18859 108 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCAND1P57086 179 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPR85P60893 370 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CAP1Q01518 475 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CLUL1Q15846 466 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM177Q53S58 311 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 TREML2Q5T2D2 321 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DYMQ7RTS9 669 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CDH24Q86UP0 819 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CHST14Q8NCH0 376 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 RAET1EQ8TD07 263 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC5A5Q92911 643 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 TNIP3Q96KP6 325 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DCTPP1Q9H773 170 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARMT1Q9H993 441 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DGAT1O75907 488 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 MBD4O95243 580 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 VCAM1P19320 739 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNM2P50570 870 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ACAP2Q15057 778 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 BROXQ5VW32 411 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CMIPQ8IY22 773 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 LCORLQ8N3X6 602 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 TRIM47Q96LD4 638 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYPNQ86TC9 1320 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 MEIS1O00470 390 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ST8SIA5O15466 376 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRKAB2O43741 272 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 AP1G1O43747 822 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 MSCO60682 206 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 THBDP07204 575 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ADD2P35612 726 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 HALP42357 657 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PLCD1P51178 756 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRMT2P55345 433 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 BACE1P56817 501 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 JAG1P78504 1218 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PAK1Q13153 545 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 STK3Q13188 491 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 SRLQ86TD4 932 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CPXCR1Q8N123 301 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DPF3Q92784 378 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 GJA10Q969M2 543 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 COA7Q96BR5 231 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 MIPEPQ99797 713 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ALG1Q9BT22 464 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNAJC18Q9H819 358 aa8.37□□□□□ -1.07
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