RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 JADE2Q9NQC1 790 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM10Q9UDY6 481 aa27.68■■■□□ 2.02
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf56Q8IXR9 622 aa27.61■■■□□ 2.01
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