RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587009.5

UBXN6-203, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 1,967 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-203ENST00000587009 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 NFASCO94856 1347 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 ZNF862O60290 1169 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 CHRNB2P17787 502 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 USP8P40818 1118 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 SAAL1Q96ER3 474 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 ALG6Q9Y672 507 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 C19orf81C9J6K1 198 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 ATP2A1O14983 1001 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 STAM2O75886 525 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 MTA2O94776 668 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 MORC4Q8TE76 937 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 BSNDQ8WZ55 320 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 SEMA4DQ92854 862 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 PPFIA4O75335 1185 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 DGAT1O75907 488 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 KRT14P02533 472 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 IRAK1P51617 712 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 PTENP60484 403 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 WRNIP1Q96S55 665 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 TTI1O43156 1089 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 GARTP22102 1010 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 ABCD1P33897 745 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 SULF1Q8IWU6 871 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 HELQQ8TDG4 1101 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 DOCK1Q14185 1865 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 CYP26A1O43174 497 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 RGS20O76081 388 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 CYP24A1Q07973 514 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 EMC10Q5UCC4 262 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 NT5C1BQ96P26 610 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 RAB20Q9NX57 234 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 PLAAQ9Y263 795 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN6-203ENST00000587009 H0YCG3 227 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 DAPK3O43293 454 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 POTEJP0CG39 1038 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 HMGCS2P54868 508 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 ALG3Q92685 438 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 RAB17Q9H0T7 212 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.08■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 HSPA6P17066 643 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 HSD17B3P37058 310 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 FMO1Q01740 532 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 MTMR3Q13615 1198 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 GPD1LQ8N335 351 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 IFT74Q96LB3 600 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 ACAD9Q9H845 621 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 PARP14Q460N5 1801 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 CYP11B1P15538 503 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 SOX10P56693 466 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 GNPTABQ3T906 1256 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 NR2E1Q9Y466 385 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 FAM187AA6NFU0 413 aa22.06■■□□□ 1.12
UBXN6-203ENST00000587009 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms