RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583763.1

CSAG4-202, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene CSAG4, Length 237 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-202ENST00000583763 LRRC71Q8N4P6 559 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG4-202ENST00000583763 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CSAG4-202ENST00000583763 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG4-202ENST00000583763 SLC39A7Q92504 469 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG4-202ENST00000583763 FAM227BQ96M60 508 aa10.96□□□□□ -0.65
CSAG4-202ENST00000583763 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CSAG4-202ENST00000583763 PTPN13Q12923 2485 aa10.96□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 NUP205Q92621 2012 aa10.96□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CAVIN2O95810 425 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 POMCP01189 267 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 POU2F2P09086 479 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 HOXA9P31269 272 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 DSC1Q08554 894 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 TRAF1Q13077 416 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 DRP2Q13474 957 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CCDC178Q5BJE1 867 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 TXNDC11Q6PKC3 985 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PIP4P1Q86T03 277 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF605Q86T29 641 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 IQCA1Q86XH1 822 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MDM1Q8TC05 714 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CLSTN3Q9BQT9 956 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MXRA8Q9BRK3 442 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 BRD9Q9H8M2 597 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 TMEM9BQ9NQ34 198 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MIOSQ9NXC5 875 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 AKT3Q9Y243 479 aa10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 A0A0D9SFI3 127 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PATE3B3GLJ2 98 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 DHX15O43143 795 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ARHGAP6O43182 974 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ADAM12O43184 909 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 AKAP3O75969 853 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 C8AP07357 584 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 GRM4Q14833 912 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 FAM78AQ5JUQ0 283 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 SWSAP1Q6NVH7 229 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 VITQ6UXI7 678 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 IRF7Q92985 503 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MKNK1Q9BUB5 465 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF302Q9NR11 478 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 GDE1Q9NZC3 331 aa10.94□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ABCA7Q8IZY2 2146 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 DCLK1O15075 740 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 SEC24BO95487 1268 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CEBPBP17676 345 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 OR1G1P47890 313 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 SOX9P48436 509 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 IRX4P78413 519 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CREB5Q02930 508 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CCINQ13939 588 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 RTP2Q5QGT7 225 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PPM1LQ5SGD2 360 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 UBXN11Q5T124 520 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 LY9Q9HBG7 655 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 SENP2Q9HC62 589 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 POLIQ9UNA4 740 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ATMQ13315 3056 aa10.93□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 J3QKU1 62 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MAGEB2O15479 319 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF862O60290 1169 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 SKIP12755 728 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 GDI1P31150 447 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 UBE2SQ16763 222 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 ZSWIM3Q96MP5 696 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 SDF4Q9BRK5 362 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 RSAD1Q9HA92 442 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.92□□□□□ -0.66
CSAG4-202ENST00000583763 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms